Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TMPOP42166 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TMPOP42166 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TMPOP42166 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TMPOP42166 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TMPOP42166 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms