Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPRMP28827 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRMP28827 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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