Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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