Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRCP08575 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRCP08575 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRCP08575 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRCP08575 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRCP08575 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTPRCP08575 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTPRCP08575 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTPRCP08575 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTPRCP08575 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRCP08575 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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