Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
LRRTM2O43300 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms