Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms