Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms