Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSME2Q9UL46 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms