Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC9Q9UKV0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms