Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP21Q9UK80 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP21Q9UK80 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP21Q9UK80 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms