Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCDC180Q9P1Z9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms