Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDE1Q9NZC3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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