Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2AIPQ9NXV6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2AIPQ9NXV6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2AIPQ9NXV6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms