Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THUMPD1Q9NXG2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms