Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms