Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms