Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP88Q99567 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP88Q99567 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms