Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALS2Q96Q42 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2Q96Q42 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms