Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC7Q96M83 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms