Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTF1AQ7RTS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms