Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC171Q6TFL3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms