Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS24

GALNT17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT17Q6IS24 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT17Q6IS24 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT17Q6IS24 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms