Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms