Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARHGAP29Q52LW3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP29Q52LW3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms