Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRY2Q49AN0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRY2Q49AN0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms