Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRNQ16849 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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