Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSRP2Q16527 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSRP2Q16527 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms