Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.595e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.475e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.085e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.63■□□□□ 0.415e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.361e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 PRSS21-205ENST00000571141 484 ntTSL 220.38■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 16.7
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PCBP1Q15365 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.454e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 RNF10-212ENST00000538796 1206 ntTSL 515.6■□□□□ 0.091e-13■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.646e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.466e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.426e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.26e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -06e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.196e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 415.21■□□□□ 0.033e-9■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.588e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.058e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 C2-204ENST00000413154 561 ntTSL 414.84□□□□□ -0.034e-9■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.583e-7■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 TMBIM1-219ENST00000465082 2874 ntTSL 213.33□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 16.7
PCBP1Q15365 SATB2-204ENST00000440919 2166 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.463e-8■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SLC16A3-207ENST00000578810 678 ntTSL 217.69■□□□□ 0.421e-8■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-8■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 526.02■■□□□ 1.765e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.35e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.115e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-212ENST00000470814 2353 ntTSL 520.97■□□□□ 0.955e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.35e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-207ENST00000431044 3173 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.195e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.075e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 BAG6-252ENST00000453833 554 ntTSL 513.48□□□□□ -0.255e-8■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.661e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-203ENST00000562464 515 ntTSL 321.19■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-211ENST00000569616 788 ntTSL 518.64■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-207ENST00000567391 667 ntTSL 315.83■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-209ENST00000568319 542 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 APRT-208ENST00000567713 470 ntTSL 512.95□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 EHD1-209ENST00000484846 3469 ntTSL 213.04□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 VPS52-222ENST00000495981 743 ntTSL 1 (best)5.24□□□□□ -1.576e-16■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-9■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 26.92□□□□□ -1.32e-9■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.573e-6■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.066e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.54e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.424e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 221.88■■□□□ 1.094e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 321.63■■□□□ 1.054e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.054e-7■■■□□ 16.6
PCBP1Q15365 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 522.29■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.058e-7■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 217.58■□□□□ 0.44e-8■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 212.32□□□□□ -0.444e-8■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.997e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-213ENST00000482309 1994 ntTSL 220.26■□□□□ 0.837e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 519.47■□□□□ 0.717e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.687e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-213ENST00000591443 657 ntTSL 218.94■□□□□ 0.627e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-215ENST00000488370 606 ntTSL 318.73■□□□□ 0.597e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-218ENST00000489192 762 ntTSL 518.72■□□□□ 0.597e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 518.32■□□□□ 0.527e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-205ENST00000466514 2199 ntTSL 218.21■□□□□ 0.517e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 518.09■□□□□ 0.497e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.437e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 216.68■□□□□ 0.267e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.27e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.057e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-217ENST00000488826 562 ntTSL 315.35■□□□□ 0.057e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-203ENST00000461373 537 ntTSL 414.96□□□□□ -0.017e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-206ENST00000466956 574 ntTSL 414.65□□□□□ -0.067e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.247e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.37e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-220ENST00000493338 694 ntTSL 311.8□□□□□ -0.527e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 ABCB8-216ENST00000488551 552 ntTSL 411.61□□□□□ -0.557e-6■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 TRIM28-214ENST00000600840 338 ntTSL 29.55□□□□□ -0.886e-11■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 321.35■■□□□ 1.018e-7■■■□□ 16.5
PCBP1Q15365 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC12.29□□□□□ -0.446e-46■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 16.4
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