Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERPUD1Q15011 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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