Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE4AQ14139 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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UBE4AQ14139 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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