Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP140Q13342 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP140Q13342 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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SP140Q13342 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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SP140Q13342 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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