Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TROQ12816 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TROQ12816 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TROQ12816 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TROQ12816 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TROQ12816 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TROQ12816 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TROQ12816 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TROQ12816 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TROQ12816 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TROQ12816 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TROQ12816 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TROQ12816 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TROQ12816 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TROQ12816 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TROQ12816 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TROQ12816 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TROQ12816 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TROQ12816 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TROQ12816 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TROQ12816 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TROQ12816 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
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