Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPEQ02224 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms