Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A3Q01959 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms