Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTNAP1P78357 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms