Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms