Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP9P55211 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP9P55211 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP9P55211 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms