Protein–RNA interactions for Protein: P54868

HMGCS2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS2P54868 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCS2P54868 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGCS2P54868 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms