Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA3P52797 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms