Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCCP43146 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCCP43146 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DCCP43146 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCCP43146 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCCP43146 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCCP43146 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCCP43146 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCCP43146 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCCP43146 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms