Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF4A3P38919 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF4A3P38919 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms