Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4AP35499 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms