Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJA4P35212 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJA4P35212 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJA4P35212 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA4P35212 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA4P35212 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms