Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms