Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA9P31269 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms