Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2AP24928 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms