Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP4O75379 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP4O75379 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms