Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM6AO15550 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM6AO15550 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms