Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA5O15230 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms