Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP290O15078 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP290O15078 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP290O15078 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP290O15078 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP290O15078 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms